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大數據時代的工具

放大字體  縮小字體 發布日期:2020-03-29  瀏覽次數:0
核心提示:▌【美】內森·沃爾夫生物工程師奎克在一個特別著名的應用實驗中,進行了既乏味又復雜的細胞培養工作。實驗
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▌【美】內森·沃爾夫

生物工程師奎克在一個特別著名的應用實驗中,進行了既乏味又復雜的細胞培養工作。實驗中,來自哺乳動物和其他生物體的細胞在實驗室環境下生長——從實驗臺到芯片上。他和團隊發明的芯片只有幾厘米長,擁有96個單間,細胞同時在里面生長幾星期時間,能夠被仔細地測量和操控。在一塊機械化生產的壓縮芯片上進行細胞培養,這項工作有很多用途,其中之一是為了評估來自大量樣本的新病毒的傳播速度和有效性。我們不難想象一個以芯片為基地的系統能夠迅速地告訴我們:一種新感染源在哪一種細胞里能存活,因此其最可能行進的傳播路徑(通過性、血液還是打噴嚏等)是哪一條。

當我們面對一次疫情的時候,有很多問題需要探究。首當其沖的問題就是:疫情背后的微生物是誰?病毒微陣列和高通量測序這些技術正在加快我們識別新型感染源的速度,也有助于我們發現舊技術沒法識別的微生物。但是一旦我們識別了一種微生物,就想知道它將走向何方。我們將在第12章里描繪最終的流行病預防系統的未來,但該系統肯定包括像安迪諾實驗室研發的,評估一種病毒所采取的進化方向的那些方法。奎克研究小組有一天也許會推出一套高速芯片,迅速評估微生物可能采取的傳播路徑。

現代信息和傳播技術為我們提供了另一套研究工具,用于從事與上面所討論的生物技術進步有所區別又互為補充的研究工作。事實上,當你閱讀這句話時,一些這樣的技術工具正躺在你的口袋里。

一個叫作埃維的橡膠種植園,位于喀麥隆西南部我們的一個研究點內,我們在那里進行實驗。這一實驗展現了公共衛生領域一個令人激動的新趨勢,雖然它只是基于簡單的手機信息的傳播。

在埃維這個大約有10萬居民的橡膠園里,每當有人生病,他們就去附近的某家診所就醫。如果病得很重,他們就從診所轉到位于橡膠園中心區域的中心醫院。然而,過去沒有好的技術方式令中心醫院可以監控那些地方診所的情況。

如今在數字流行病學領域領導我們項目的拉奇·古拉斯卡拉,是非營利組織“短信前線:醫生”的創辦人之一。幾年前,他與該組織的合作伙伴們創建了一個基于手機短信的簡單系統,使中心醫院能夠監控地方診所里的情況。通過簡單地發送一系列預置代碼,診所里大部分關鍵性信息能夠清楚、持續而有效地在醫學體系里層層上傳。使用預置代碼和簡單的短信形式,地方診所能夠迅速地告知其他人所收治的瘧疾、腹瀉和其他疾病的病例數。?(16)

 
 
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